#include "fast_winding_number.h"
#include "../../fast_winding_number.h"
#include "../../octree.h"
#include "../../knn.h"
#include "../../parallel_for.h"
#include "point_areas.h"
#include <vector>

template <
  typename DerivedP, 
  typename DerivedN, 
  typename DerivedQ,
  typename BetaType, 
  typename DerivedWN>
IGL_INLINE void igl::copyleft::cgal::fast_winding_number(
  const Eigen::MatrixBase<DerivedP>& P,
  const Eigen::MatrixBase<DerivedN>& N,
  const Eigen::MatrixBase<DerivedQ>& Q,
  const int expansion_order,
  const BetaType beta,
  Eigen::PlainObjectBase<DerivedWN>& WN)
{
  typedef typename DerivedWN::Scalar real;
  typedef typename Eigen::Matrix<real,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic>
    RealMatrix;
        
  std::vector<std::vector<int> > point_indices;
  Eigen::Matrix<int,Eigen::Dynamic,8> CH;
  Eigen::Matrix<real,Eigen::Dynamic,3> CN;
  Eigen::Matrix<real,Eigen::Dynamic,1> W;
  Eigen::MatrixXi I;
  Eigen::Matrix<real,Eigen::Dynamic,1> A;
  
  octree(P,point_indices,CH,CN,W);
  knn(P,21,point_indices,CH,CN,W,I);
  point_areas(P,I,N,A);
  
  Eigen::Matrix<real,Eigen::Dynamic,Eigen::Dynamic> EC;
  Eigen::Matrix<real,Eigen::Dynamic,3> CM;
  Eigen::Matrix<real,Eigen::Dynamic,1> R;
  
  igl::fast_winding_number(
    P,N,A,point_indices,CH,expansion_order,CM,R,EC);
  igl::fast_winding_number(
    P,N,A,point_indices,CH,CM,R,EC,Q,beta,WN);
}
      
template <
  typename DerivedP, 
  typename DerivedN, 
  typename DerivedQ, 
  typename DerivedWN>
IGL_INLINE void igl::copyleft::cgal::fast_winding_number(
  const Eigen::MatrixBase<DerivedP>& P,
  const Eigen::MatrixBase<DerivedN>& N,
  const Eigen::MatrixBase<DerivedQ>& Q,
  Eigen::PlainObjectBase<DerivedWN>& WN)
{
  fast_winding_number(P,N,Q,2,2.0,WN);
}

#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
// Explicit template instantiation
template void igl::copyleft::cgal::fast_winding_number<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int, double, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
#endif
