Комбинации клавиш обеспечивают более быструю и удобную навигацию по рабочему столу. При этом скорость и эффективность работы с применением комбинаций клавиш может быть настолько высока, что вызовет удивление друзей, наблюдающих за вашей работой. Наиболее общеупотребительные и хорошо известные комбинации клавиш — это «Сохранить» и «Выйти» в Microsoft Windows: Ctrl + S и Ctrl + Q, соответственно. Mate позволяет настроить использование комбинаций клавиш для множества различных областей на рабочем столе. Интерфейс комбинаций клавиш предельно прост и содержит всего один параметр для определения используемой в приложениях схемы комбинаций клавиш. Этот параметр имеет всего два значения: «По умолчанию» и «Emacs». Схема «По умолчанию» содержит «Control + S» и другие комбинации, известные большинству пользователей по операционной системе Microsoft Windows. Emacs является популярным текстовым редактором для операционных систем на базе Linux и Unix. Комбинации клавиш в Emacs отличаются от тех, которые используются в схеме «По умолчанию». Например, сохранение производится с помощью комбинации клавиш «Control + X S».